Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中细菌表观遗传标示的存在

2021-11-15 03:09:30 来源:
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结语:在晚期前期,生物就开始了在不改变细菌细胞膜DNA组织起来顺序的前提原地使其DNA发挥各不不尽相同的功能,而这就是通过给DNA亚基上移除化学上面来借助于的。DNA酮化是哺乳动器物的关键微小持续性状机制,其中的5-酮胞嘧啶(5mc)是最相似的DNA结构上之一。6mdA是细菌这两项结构上系统的基本组合而成成分,现阶段在哺乳动器物中的缺乏可知的这两项结构上系统。当初有不少研究成果美联社,6mdA也假定于哺乳动器物中的,但并无论据支持。

近日,在《科学研究十分困难》上的一项研究成果中的,冰岛林雪平大学的研究成果管理人员说明了,哺乳动器物细胞膜中的假定细菌微小持续性状上面很可能会被环境污染了,并且无法必要的论据来断言哺乳动器物中的假定这种结构上。

N6-酮N-(6mdA)是细菌中的广泛的DNA结构上,但近期在哺乳动器物DNA中的也得到了表征。然而,研究成果管理人员写道,即使对来自不尽相同哺乳动器物细胞膜类型的DNA进行的6mdAXPS和金属量测量研究成果也不完全一致。

为了大幅度探究6mdA在哺乳动器物由此可知配置中的的功用,研究成果管理人员借助于了人体内将人类固执T辅助(NTH)细胞膜分化为TH细胞膜亚群的能力也。但是,与当初的研究成果相反,他们找到TH分化现实生活中的6mdA的金属量无法当前转变,并且仔细观察到分化的T细胞膜中的的6mdA高度与未曾酮化的全基因组导入DNA不尽相同,这说明了6mdA并未曾以可测定的高度假定人类T细胞膜中的。

他们还研究了从六个人类细胞膜系中的分离出的DNA中的的6mdA,并鉴定出两个具高于背景噪音高度的6mdA高度的细胞膜系。出乎意料的是,两种单独的293T细胞膜系培养器物具各不不尽相同的6mdA高度,这说明了研究成果管理人员仔细观察到的6mdA路径并非细胞膜类型本身固有的。确实,当他们大幅度看时,他们找到两条6mdA高度增大的细胞膜系被支原体种属环境污染,支原体种属一种相似的细菌细胞膜培养器物中的富含6mdA的环境污染器物。当他们用支原体特异持续性抗生素Plasmocin处理细胞膜系时,6mdA路径减少为A复数解读。

“我们发现自己通过这些核心技术测定到的6mdA'路径'只是噪音。但是,由于一些复杂的核心技术难题,几种工具中的的背景噪音不是随机的,而是相符路径。”低阶作者Colm Nestor(尼尔默·内斯特)在一份声明中的感叹。

研究成果管理人员研究了从前通过DNA免疫沉淀核酸、铯和单底器物实时核酸在哺乳动器物细胞膜中的定位或测定6mdA的努力。人们找到每种工具都有局限持续性或缺陷,使微小持续性状上面的假阳持续性找到率很高,似乎说明了林雪平研究成果管理人员普遍认为不假定这种周期持续性的论据。

这组作者写道:“我们断言,RNA和细菌环境污染、抗原交叉化学反应持续性和其他核心技术限制的结合已导致6mdA在哺乳动器物DNA中的的一一误解辨识。随着DNA和RNA结构上家族的大大增加,以及从前未曾知结构上的丰富持续性越来越罕见,即使用到多种互为工具,我们也凸显了误解找到的可能会持续性。我们表示同意用到结构上和未曾结构上的基因组DNA标准作为今后对稀有DNA结构上的研究成果的最低要求,以及在用到前更更进一步地验证抗原特异持续性。”

内斯特不足之处感叹,研究成果管理人员在研究成果更加罕见的周期持续性时必须更加小心,自由选择用到哪种工具,并考虑他们是否真正在衡量假定的事器物。他感叹:“现在我们可以也许地感叹哺乳动器物中的不假定6mdA。关于6mdA,如果研究成果管理人员停止研究成果根本不假定的过道,则可以节省大量间隔时间和借贷,并且避免了很多引人欣慰的事。”

原始注解:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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